Kursen omfattar två moment:
1. Teoridel, 9 hp.
Mikroorganismer är mycket rikligt förekommande och mer fylogenetiskt diversifierade än växter och djur. Överflödet och diversiteten hos allt levande på jorden har också sitt ursprung hos prokaryoter. Mikroorganismer interagerar med alla levande varelser men också med den icke-levande världen och påverkar således hela biologin, även geobiologi. I många år, har forskning där man använder prokaryoter från domänerna Bacteria och Archaea som modellsystem kraftigt ökat förståelsen av fysiologiska processer såsom tillväxt och metabolism. Genom förståelse av prokaryoternas fysiologi, har även stora framsteg inom ekologi, evolution och bioteknologi kunnat göras. Kursen ger en översikt av mikrobiell diversitet och den metodik som används för klassificering av arterna inom Bacteria och Archaea. Kursen ger också en fördjupning av de fundamentala fysiologiska processerna hos dessa. Speciellt behandlas cellulära struktur-funktionssamband, tillväxtprofiler, membranfunktioner med tonvikt på bioenergetik och transport, samt fysiologiskt unika bakterietyper. De molekylära mekanismerna bakom mikrobiell adaption till en ständigt föränderlig omgivning kommer att diskuteras liksom prokaryoternas unika livsstilar
2. Laborationsdel, 6 hp.
Laborationsdelen är en praktisk tillämpning av det teoretiska innehållet, bland annat genomförs ett självdesignat experiment med isolering och klassificering av bakterier med hjälp av PCR, DNA-sekvensering och databassökningar. Vidare illustreras bakteriers sammansättning vid tillväxt under olika tillväxtförhållanden, bakteriers avkänning av och respons på omgivningen genom kemotaxi, bakterieaktiviteter som kräver en större population för att kunna utföras, vilka samordnas genom cell-cell-kommunikation. Slutligen behandlas bildande av bakteriella biofilmer och de krav som ställs för detta.
Förväntade studieresultat
Efter avslutad kurs ska studenten
- visa fördjupad förståelse av vad mikrobiell diversitet är, dess betydelse för livet på jorden samt relevanta metoder för att studera denna.
- kunna beskriva struktur-funktionssamband i prokaryoter samt skillnader mellan Archaea och Bacteria.
- kunna beskriva de viktigaste prokaryota strukturerna och deras kemiska sammansättning och funktion.
- redogöra för de olika tillväxtfaserna hos prokaryoter, förändringarna av cellsammansättningen under dessa faser, cellkommunikationssystem som reglerar tillväxtrespons samt tillväxt under extrema förhållanden.
- beskriva membranbioenergetik hos prokaryoter, inkluderande elektrontransport i olika bakterier, proton-motive force samt upptag och transport över membranet.
- översktligt kunna beskriva basal metabolism såsom kol-, kväve-, svavel- och järncyklerna och deras relevans för liv på jorden.
- visa praktisk färdighet vid odling och analys av bakterier
Behörighetskrav
Univ: Avklarade kurser om minst 45 hp inom biovetenskapsområdet varav minst 7,5 hp mikrobiologi och minst 7,5 hp genetik och sammanlagt minst 15 hp inom områdena växt- och zoofysiologi samt cell- och molekylärbiologi. Avklarade kurser i kemi om minst 30 hp, varav minst 7,5 hp biokemi. Dokumenterad färdighet i experimentellt arbete omfattande minst 30 hp. Engelska B från gymnasiet, eller motsvarande kunskaper.
Undervisningens upplägg
Undervisningen omfattar föreläsningar, lektioner, och laborationer men kan även inkludera seminarier och uppsatsdiskussioner. Laborationer är alltid obligatoriska men andra moment kan obligatorieläggas enligt aktuellt schema.
Examination
Examinationen sker dels genom en skriftlig tentamen på teoridelen, dels genom skriftlig redovisning av laborationsmomenten som också examineras fortlöpande. På en skriftlig tentamen sätts något av betygen Underkänd (U), Godkänd (G) och Väl godkänd (VG). På laborationsmomentet ges betygen Underkänd (U) eller Godkänd (G). På hela kursen ges något av betygen Underkänd (U), Godkänd (G) eller Väl godkänd (VG). För studerande som inte blivit godkänd vid ordinarie provtillfälle anordnas ytterligare provtillfälle. Studerande som två gånger underkänts i prov, har rätt att hos institutionsstyrelsen för molekylärbiologi begära att annan lärare utses för att sätta betyg på honom/henne i förnyat prov. Den som godkänts i ett prov får ej undergå förnyat prov för högre betyg.
Litteratur
Litteraturlistan är inte tillgänglig via den webbaserade utbildningskatalogen.
Kontakta aktuell institution.
