Kursens innehåll syftar till att ge en djup förståelse av moderna NMR och röntgen baserande tekniker i strukturbiologi med inriktning mot medicinskt och biologiskt relevanta problem. Huvudsyftet är förståelse och användning av strukturbiologiska strategier för att bestämma tredimensionella strukturer av lösliga proteiner, DNA och RNA men också olösliga biologiska material i fast fas som proteinfibriller, membranproteiner, cellmembraner eller brosk. För att uppnå dessa färdigheter använder studenten modern vätske/fastfast NMR-utrustning och röntgenkristallografi för att studera struktur av lösliga och ickelösliga, mediciniskt relevanta biomolekyler. Under kursens gång får studenten även färdigheter i att visualisera 3D strukturer av makromolekyler i olika datorprogram. Tillämpningar innefattar också karakterisering av strukturförändringar kopplade till biologisk aktivitet samt hur läkemedel och små organiska molekyler växelverkar med biologiska makromolekyler.
Förväntade studieresultat
Efter genomgången kurs skall studenten kunna: - redogöra för grundläggande principer av hur NMR spektroskopi kan användas för strukturbestämning av proteiner och andra biologiska makromolekyler. - förklara sammanhanget mellan den tredimensionella strukturen och funktion hos proteiner, DNA och RNA. - redogöra för grundläggande teori och praktik bakom röntgenkristallografi och NMR spektroskopi. - visualisera protein- och nukleinsyrorstrukturer med datorgrafik. - självständig planera och utföra problemanpassade NMR experiment för strukturbestämning av små organiska molekyler samt biomolekyler som proteiner, DNA, RNA och deras komplex med små organiska molekyler. - tillämpa strukturbiologiska strategier rörande proteinaggregation, biologiska membran och membranproteiner och deras funktion som ”drug targets” i industri. - presentera erhållna resultat muntligt och skriftligt.
Behörighetskrav
För tillträde till kursen krävs godkända kurser i kemi om 60 hp samt kursen Avancerade experimentella kemiska verktyg (15 hp, 5KE125), eller motsvarande. Engelska A och svenska för grundläggande behörighet för högskolestudier om utbildningen ges på svenska.
Undervisningens upplägg
Kursen omfattar två moment. 1. Tillämpad NMR som innehåller grundläggande NMR teori och praktiska tillämpningar av NMR från små organiska molekyler till peptider (6 hp). 2. Avancerad strukturbestämning av proteiner och andra biopolymerer och deras komplex med hjälp av Röntgenkristallografi och NMR-spektroskopi med teoretisk och praktisk inblick (9 hp). Tonvikt kommer dock att vara inriktad på att varje student tränas i att arbeta individuellt och självständigt i ett projekt. Undervisningen bedrivs i form av föreläsningar, lektioner, gruppövningar, studiebesök, laborationer, demonstrationer och projektarbete. Laborationerna med tillhörande gruppövningar är obligatoriska.
Examination
Kunskapsredovisningen sker dels i form av skriftlig avrapportering av de laborativa projekten, och dels i form av ett skriftligt prov på teoridelen vid kursens slut. På de laborativa projekten och redovisningarna sätts något av betygen Underkänd (U) eller Godkänd (G). På skriftliga prov, och på hel kurs, sätts något av betygen Underkänd (U), Godkänd (G) eller Väl godkänd (VG). Betyg på kursen sätts först när samtliga prov och obligatoriska moment är godkända. Den som godkänts vid ett prov får ej undergå förnyat prov för högre betyg. En student som utan godkänt resultat har genomgått två prov för en kurs eller en del av en kurs, har rätt att få en annan examinator utsedd, om inte särskilda skäl talar emot det (HF 6 kap. 11b §). Begäran om ny examinator ställs till prefekten vid Kemiska institutionen.
Tillgodoräknande prövas alltid individuellt (se universitetets regelsamling och tillgodoräknandeordning).
Litteratur
Litteraturlistan är inte tillgänglig via den webbaserade utbildningskatalogen.
Kontakta aktuell institution.
