Introduktion till det "kemometriska konceptet": I detta moment ges studenterna en överblick det kemometriska konceptet och hur kemometri fungerar som en röd råd i, (i) definition av mål, (ii) planering av experiment, (iii) skapande av informationsrika data, (vi) modellering och utvärdering, (v) visualisering av stora datamängder, samt (v) validering och prediktioner.
Grunderna i (kemisk) dataanalys: I detta moment ligger fokus på modellbegreppet och variabilitet samt hur modeller av variabilitet kan användas i dataanalys. Grunderna för univariat statistisk analys gås igenom.
Anpassning av modeller till data: I detta moment behandlas klassiska statistiska metoder för anpassa modeller till experimentella data. Här betonas också förståelsen av systematisk och icke systematisk variation.
Försöksplanering (experimentell design): I detta moment behandlas, hur försöksplanering (experimentell design) kan användas för att göra så att data innehåller information, hur dessa data kan anlyseras och utvärderas samt hur man kan använda denna filosofi för att optimera (kemiska) system och processer där många variabler påverkar utfallet. Olika typer av experimentella designer, analys- och optimeringsmetoder tas upp.
Multivariat dataanalys: I detta moment behandlas hur stora komplexa datamängder (tabeller) uppbyggda av ett stort antal korrelerade variabler kan analyseras så att, (i) en överblick av multivariata data kan erhållas, (ii) likheter och skillnader mellan prover kan detekteras och tolkas, (iii) relationen mellan block (tabeller) av data kan modelleras och tolkas. Olika typer av multivariata projektionsmetoder såsom principalkomponentanalys (PCA), partial least squares projections to latent structures (PLS) och ortogonal PLS (OPLS) gås igenom.
QSAR modellering: I detta moment belyses (i) alternativa metoder att beräkna kemiska deskriptorer, dess begränsningar och möjligheter, (ii) multivariat kemisk karakterisering av komplexa datamatriser såsom stora kemikaliedatabaser och inventeringar av industrikemikalier, (iii) olika typer av QSAR-modeller och hur de kan användas för riskbedömning av kemikalier, samt (iv) alternativa metoder för att generara data för riskbedömning.
Dessutom ingår ett projektarbete motsvarande ca 3p.
Förväntade studieresultat
Efter avslutad kurs ska studenten kunna: - teoretisk såväl som praktisk förståe det kemometriska konceptet för tolkning av komplexa (kemiska) data och processer. - planera och utvärdera (kemiska) experiment där många variabler påverkar utfallet. - analysera och utvärdera såväl univariata som multivariata mätdata. - behärska typiska multivariata tillämpningar inom naturvetenskap och industri såsom, kvantitativa struktur egenskaps samband, multivariat kalibrering, multivariat klassificering samt monitorering och kontroll av industriella och andra processer. - kritiskt granska och redogöra för innehållet i vetenskapliga artiklar inom kemometriområdet. - redovisa ett projektarbete såväl muntligt som skriftligt. - kommunicera principer, problem och forskningsresultat med med såväl experter som ickespecialister inom kemometriområdet i frågor som ligger inom ramen för kursens innehåll. - tillgodogöra sig en sådan kunskap om det kemometriska konceptet så att hon/han ska kunna applicera/administrera detta för tillämpningar inom forskning eller industri. - QSAR-modellering inklusive: - beräkning av kemiska deskriptorer - beräkning, optimering och validering av QSAR-modeller - alternativa metodiker inom QSAR området (t.ex. expert system) - typiska tillämpningar och möjligheter för QSARs inom riskbedömningsområdet
Behörighetskrav
Univ: Godkända kurser i kemi om 45 hp eller motsvarande
Undervisningens upplägg
Kursen går parallellt med kursen Kemometri (5KE052) och flera moment delas mellan kurserna. Projektarbete samt ett antal föreläsningar är direkt inriktade mot QSAR. I kursen ingår såväl föreläsningar, övningar som ett projektarbete.
Examination
Kunskapsredovisningen sker normalt genom ett skriftligt prov vid kursens slut, men också fortlöpande i samband med undervisningen i form av prov, övningar och redovisningar. I kursen ingår ett projektarbete som redovisas såväl muntligt som skriftligt.
Studerande, vilka ej blivit godkända vid ordinarie provtillfälle, har rätt till förnyat prov. Studerande som mer än två gånger underkänts i prov har rätt att hos Kemiska institutionens styrelse begära att annan examinator utses.
Betyg på kursen sätts först när prov, laborationskurs samt projekt är godkända. Betygsskalan består av betygen Underkänd (U), Godkänd (G) eller Väl godkänd (VG). TILLGODORÄKNANDE Tillgodoräknande prövas alltid individuellt (se universitetets regelsamling och tillgodoräknandeordning).
Litteratur
Litteraturlistan är inte tillgänglig via den webbaserade utbildningskatalogen.
Kontakta aktuell institution.
