Biokemi - Proteiners struktur och funktion, 15 hp

Innehåll

Proteiners struktur och funktion är ett centralt tema i en stor del av modern forskning och bioteknologisk verksamhet. För att kunna förstå biologiska och biokemiska förlopp på en molekylär nivå är det ofta en förutsättning att känna till ett specifikt proteins struktur. Kursen syftar framförallt till att ge djup kunskap i proteiners struktur, samt hur de är uppbyggda, fungerar och stabiliseras. Proteiner kommer att studeras både från ett teoretiskt och prakiskt-laborativt perspektiv. Detta innefattar proteiners evolution, struktur, dynamik, termodynamik, stabilitet och veckning. Kursen innehåller även studier av specifika proteiner och deras domäner, bl.a membranproteiner, immunoglobuliner, enzymer, och DNA-bindande proteiner. Proteiner visualiseras enklast med molekylgrafik, en del av kursen ägnas åt att studera proteiners struktur och funktion med hjälp av molekylgrafikprogram.
Den laborativa delen av kursen ger praktisk färdighet i att studera proteiners stabilitet och veckning med moderna biofysikaliska instrument. Tonvikt läggs också på att konstruera modeller för att tolka och analysera insamlade rådata. Ett litteraturseminarium hålls med utgångspunkt från en relevant vetenskaplig artikel.

Förväntade studieresultat

Efter genomgången kurs skall den studerande kunna:

• diskutera proteiners evolution
• beskriva hur proteiner är uppbyggda
• redogöra för interaktioner som håller samman proteiner
• beskriva hur ett protein stabiliseras termodynamiskt
• redogöra för hur proteinstrukturer kan bestämmas.
• beskriva och diskutera de viktigaste domänstrukturerna hos proteiner
• beskriva och diskutera samband mellan proteiners struktur och biologiska funktion och hur riktad mutagenes används för att få kunskap om sådana samband
• använda molekylgrafik för att analysera och visualisera proteinstrukturer
• genomföra datoriserade litteratursökningar
• presentera vetenskapliga uppsatser i seminarieform.
• designa och utföra experiment för att studera proteiners veckning och stabilitet
• presentera ett vetenskapligt arbete i uppsatsform.

Behörighetskrav

Univ: Biokemi (5KE075/20), 15 hp, eller motsvarande.
Engelska A/5 och svenska för grundläggande behörighet för högskolestudier om utbildningen ges på svenska.

Undervisningens upplägg

Undervisningen bedrivs i form av föreläsningar, lektioner, gruppövningar, demonstrationer och laborationer. Laborationerna med tillhörande gruppövningar är obligatoriska.

Examination

Examinationen sker dels genom skriftlig tentamen (på teoridelen), dels genom skriftlig redovisning av laborationsmoment samt genom muntligt litteraturseminarium. På en skriftlig tentamen liksom laborationsmomentet sätts något av betygen Underkänd (U), Godkänd (G), Väl godkänd (VG). På hela kursen ges något av betygen Underkänd (U), Godkänd (G), Väl godkänd (VG). För att bli godkänd på hela kursen krävs att samtliga prov och obligatoriska moment är godkända. Betyget utgör en sammanfattande bedömning av resultaten vid examinationens olika delar och sätts först när alla obligatoriska moment är godkända. Den som godkänts i prov får ej undergå förnyat prov för högre betyg.
En student som utan godkänt resultat har genomgått två prov för en kurs eller en del av en kurs, har rätt att få en annan examinator utsedd, om inte särskilda skäl talar emot det (HF 6 kap. 22§). Begäran om ny examinator ställs till styrelsen för Kemiska institutionen.
TILLGODORÄKNANDE
Tillgodoräknande prövas alltid individuellt (se universitetets regelsamling och tillgodoräknandeordning).