Kvantitativ modellering av livets byggstenar, 7,5 hp
Kursen är nedlagd
Engelskt namn: Quantitative modelling of the building blocks of life
Denna kursplan gäller: 2016-10-31
och tillsvidare
Kurskod: 5BI216
Högskolepoäng: 7,5
Utbildningsnivå: Avancerad nivå
Huvudområden och successiv fördjupning:
Biologi: Avancerad nivå, har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
Fysik: Avancerad nivå, har endast kurs/er på grundnivå som förkunskapskrav
Betygsskala: Med beröm godkänd, icke utan beröm godkänd, godkänd, väl godkänd, godkänd, underkänd
Ansvarig institution: Institutionen för fysiologisk botanik
Den tekniska utvecklingen medför att cellulära processer kan mätas allt noggrannare i tid och rum, vilket samtidigt ger en möjlighet att med större precision utforma och testa kvantitativa modeller av cellulära processer. Dessa modeller kan analyseras analytiskt och numeriskt och därigenom skapa en ökad förståelse för de olika egenskaper cellen uppvisar men också en möjlighet att förstå egenskaper cellen inte uppvisar. I denna kurs ges först en överblick av cellers olika byggstenar, deras storlek och antal. Sedan studeras rums och tidsskalor hos olika fysikaliska och kemiska processer i cellen. I kursen presenteras också hur cellens molekyler, genom ett nätverk av interaktioner, kan bearbeta information om sin miljö och utifrån denna styra olika cellulära processer. Kursen ger en grund för att kvantitativt studera cellulära processer med matematiska verktyg och med datorsimuleringar. Kursens innehåll ligger nära aktuell forskning och bygger på en tvärvetenskaplig integration av kunskap från fysik, kemi, biologi, matematik och datavetenskap.
Förväntade studieresultat
Efter genomgången kurs skall den studerande kunna: - Uppvisa förmåga att formulera och analysera kvantitativa modeller av komplexa biologiska processer genom att tillämpa fysikaliska principer på biologiska storheter. - Uppvisa förmåga att numeriskt simulera cellulära processer, deterministiskt och stokastiskt. - Uppvisa förmåga att applicera metoder från kontrollteori på genetiska reglersystem. - Kvantifiera cellulära längd- och tidsskalor. - Presentera resultat muntligt såväl som skriftligt.
Behörighetskrav
Minst 90hp varav Envariabelanalys 1 och 2, Linjär algebra samt Differentialekvationer ingår, eller motsvarande.
Undervisningens upplägg
Undervisning bedrivs i form av föreläsningar samt problemlösning i grupp.
Examination
Examinering sker genom en skriftlig tentamen vid kursens slut och genom inlämningsuppgifter under kursens gång. Den skriftliga tentamen bedöms med något av resultaten med beröm godkänt (5), Icke utan beröm godkänt (4), Godkänd (3), Underkänd (U), alternativt, Väl Godkänd (VG), Godkänd (G), Underkänd (U). Inlämningsuppgifter bedöms med betyget Godkänd (G), Underkänd (U). Om inlämningsuppgifterna eller/och den skriftliga tentamen ges betyget Underkänd (U) erhålls betyget Underkänd (U) på kursen. Om inlämningsuppgifterna bedöms som Godkänd (G), betygssätts kursen med det betyg som erhållits i den skriftliga tentamen. Studerande som ej blivit godkänd vid ordinarie examinationstillfälle har rätt till förnyat prov och kommer att erbjudas ytterligare examinationstillfällen efter överenskommelse med kursansvarig lärare. Studerande som godkänts i ett prov får ej undergå förnyat prov för att få högre betyg. Studerande som av samma lärare underkänts två gånger i ett prov har rätt att hos prefekt för Institutionen för Fysiologisk Botanik begära att en annan lärare utses att bestämma betyg åt henne/honom, för det aktuella provet.
Litteratur
Giltig från:
2016 vecka 44
Physical biology of the cell Phillips Rob, Kondev Jane, Theriot Julie, Garcia Hernan G. 2. ed. : New York, NY : Garland Science : cop. 2013 : xxx, 1057 s. : ISBN: 978-0-8153-4450-6 (pbk.) Se Umeå UB:s söktjänst
