Kursen syftar till att ge en stark teoretisk bas samt tillämpning av tekniker för funktionell genomanalys i växter, en storskalig analys av olika genprodukters funktion i växten. Genom studierna kommer studenterna att få insikt i den nya information som kommer att kunna genereras genom helgenom-/proteom-/metabolomanalys. Studenterna får praktiskt lära sig att ställa upp och utföra ett försök för storskalig genomanalys.
Förväntade studieresultat
Efter avklarad kurs skall studenterna kunna: - förstå och beskriva koncepten Genomik, Proteomik, Metabolomik - beskriva olika strategier för storskalig sekvensering, genom sekvensering, fördelar och nackdelar med dessa. - beskriva generella principer för Differentiell Gen Expression analys (DGE, transkriptom analys), och kriterier för dessa. - beskriva tekniker som används för Proteomik studier. - beskriva tekniker som används för Metabolomik studier. - beskriva svårigheterna med och lösningar till visualisering av hög-densitets data. - beskriva hur man kan jobba med ett växtmodell system för att klargöra specifika geners eller proteiners funktion i växten.
Behörighetskrav
Växters cell- och molekylärbiologi 15 hp (5BI092), Tillväxt och utveckling hos växter 15 hp (5BI091) och Computational Life Science 15 hp (5BI134) eller motsvarande. En B och svenska för grundläggande behörighet för högskolestudier om utbildningen ges på svenska.
Undervisningens upplägg
Kursen är projektbaserad. Under kursen blandas föreläsningar, litteraturstudier med projektplanering och utförande av projekt. Det praktiska arbetet utförs i grupper om 2-3 studenter. Handledaren ger stöd vid arbetets planering och genomförande. Arbetet sammanställs i en vetenskaplig rapport samt redovisas muntligt.
Examination
Kursen examineras med skriftlig rapportskrivning samt muntlig presentation. För godkänt betyg på kursen krävs även att man deltagit i litteraturdiskussioner, rapportskrivning och muntlig rapportpresentation, samt att inlämnade skriftliga diskussionsprotokoll godkänts. Betyg som ges är 5 (Med beröm godkänd, 4 (Icke utan beröm godkänt), 3 (Godkänd), Underkänd (U), Godkänd (G) samt Väl Godkänd (VG). Studerande som underkänts, har rätt att undergå förnyat prov för att få godkänt betyg. En student som utan godkänt resultat har genomgått två prov för en kurs eller en del av en kurs, har rätt att få en annan examinator utsedd, om inte särskilda skäl talar emot det (HF 6 kap. 22 §). Begäran om ny examinator ställs till prefekten vid institutionen för fysiologisk botanik.
Litteratur
Litteraturlistan är inte tillgänglig via den webbaserade utbildningskatalogen.
Kontakta aktuell institution.
