Proteiner är biologiska makromolekyler som är nödvändiga för livet. De utför viktiga funktioner, som att tillhandahålla struktur till celler och vävnader, katalysera metaboliska reaktioner, transportera molekyler eller sända signaler. Dessa funktioner bestäms av deras kemiska egenskaper och fysikaliska interaktioner. Denna kurs behandlar de termodynamiska principer som leder till proteiners struktur, stabilitet och interaktioner, och den teoretiska grunden för metoder för att studera proteinstruktur och funktion. Kursen ger praktisk erfarenhet av att designa och utföra experiment för att undersöka biofysiska egenskaper hos proteiner, samt diskussion om hur dessa påverkar funktionen. Kursen behandlar även molekylgrafik för att visualisera proteiners struktur.
Förväntade studieresultat
Efter genomgången kurs skall den studerande kunna:
Identifiera olika motiv och domäner i proteinstrukturer och hur dessa relaterar till funktion.
Förstå och använda de termodynamiska principer som bestämmer proteiners struktur och veckning, hur och dessa påverkar funktion.
Förstå och beskriva metoderna för att bestämma proteinstruktur, och föreslå vilken som är mer adekvat för att studera ett visst protein.
Använd principerna för molekylär igenkänning för att förstå interaktioner med proteiner.
Relatera det teoretiska ramverket för katalys till dess tillämpning för att studera enzymfunktion.
Använda molekylgrafik för att visualisera proteinstruktur och förutsäga deras funktion.
Designa och utföra experiment för att studera vilka aspekter av strukturen som är viktiga för proteiners stabilitet, struktur och funktion.
Kritiskt diskutera resultaten av experiment utformade för att studera proteinstabilitet, struktur och funktion.
Behörighetskrav
90 hp inklusive kursen Biokemi 15 hp (5KE020/075) eller Biokemi, Proteinkemi och enzymkinetik (5KE076) eller motsvarande samt Engelska 6/A.
Undervisningens upplägg
Undervisningen bedrivs i form av föreläsningar, gruppövningar, demonstrationer och laborationer. Deltagande i laborationsmomenten är obligatoriskt.
Examination
Kursen examineras genom en skriftlig tentamen på den teoretiska delen samt skriftlig rapport och dess muntliga presentation och diskussion på laborationsdelen. Den skriftliga tentamen bedöms med Underkänd (U), Godkänd (G) eller Väl Godkänd (VG), och laborationsdelen betygsätts med Underkänd (U) eller Godkänd (G). På hela kursen ges betygen Underkänd (U), Godkänd (G) eller Väl Godkänd (VG). För att bli godkänd på hela kursen krävs att alla prov och obligatoriska moment är godkända. Betyget utgör en samlad bedömning av resultaten av tentamens olika delar och sätts inte förrän alla obligatoriska moment är klara.
Den som godkänts i prov får ej undergå förnyat prov för högre betyg.
En student som utan godkänt resultat har genomgått två prov för en kurs eller en del av en kurs, har rätt att få en annan examinator utsedd, om inte särskilda skäl talar emot det (HF 6 kap. 22§). Begäran om ny examinator ställs till prefekt vid Kemiska institutionen.
För studerande som inte blivit godkänd vid ordinarie provtillfälle anordnas förnyat provtillfälle i enlighet med Umeå universitets Regler för betyg och examination på grundnivå och avancerad nivå (FS 1.1-574-22). Det första omprovet erbjuds senast två månader efter ordinarie provtillfälle. Undantaget de fall då ordinarie prov äger rum i maj eller juni månad, då erbjuds istället ett första omprovstillfälle inom tre månader efter ordinarie provtillfälle. Dessutom erbjuds ytterligare minst ett omprov inom ett år från ordinarie provtillfälle.
Examinator kan besluta om avsteg från kursplanens examinationsform. Individuell anpassning av examinationsformen ska övervägas utifrån studentens behov. Examinationsformen anpassas inom ramen för kursplanens förväntade studieresultat. Student som har behov av en anpassad examination ska senast 10 dagar innan examinationen begära anpassning hos kursansvarig institution. Examinator beslutar om anpassad examination som sedan meddelas studenten.
Övriga föreskrifter
I det fall att kursplan upphör att gälla eller genomgår större förändringar, garanteras studenter minst tre provtillfällen (inklusive ordinarie provtillfälle) enligt föreskrifterna i den kursplan som studenten ursprungligen varit kursregistrerad på under en tid av maximalt två år från det att tidigare kursplan upphört att gälla eller att kursen slutat ges.
TILLGODORÄKNANDE Tillgodoräknande prövas alltid individuellt (se universitetets regelsamling och tillgodoräknandeordning).
Litteratur
Giltig från:
2023 vecka 40
The molecules of life : physical and chemical principles Kuriyan John., Konforti Boyana., Wemmer David. New York : Garland Science : 2013. : xxii, 1008 p. : ISBN: 978-0-8153-4188-8 Obligatorisk Se Umeå UB:s söktjänst
