Biträdande universitetslektor
För mer information, gå till vår hemsida: microbe.dev
Laura Carrolls labb utvecklar och använder bioinformatiska metoder för att övervaka och bekämpa spridningen av bakteriella patogener.
(Meta)genomisk sekvensering spelar en allt mer avgörande roll i klinisk och folkhälsomikrobiologi. Som sådan växer mängden offentligt tillgängliga (meta)genomiska data från mikrober – inklusive patogener – snabbt. Som en beräkningsmikrobiologigrupp utvecklar och använder vi bioinformatiska tillvägagångssätt, som kan utnyttja dessa enorma datamängder för att förbättra patogenövervakning, källspårning, utbrottsdetektering och riskutvärderingsinsatser.
Specifikt utvecklar och distribuerar vi fylodynamiska modeller, som kan användas för att spåra utvecklingen och överföringen av zoonotiska patogener mellan djurreservoarer och den mänskliga befolkningen; metoder för maskininlärning, som kan användas för att identifiera mikrobiella genomiska determinanter associerade med fenotyper av klinisk och industriell betydelse (t.ex. värdsjukdomstillstånd, fenotyper av antimikrobiell resistens); och multiomics-metoder, som kan användas för att förutsäga patogenvirulenspotential.
Vi vill överbrygga överbrygga klyftan mellan experimentella och beräkningsmikrobiologer genom att göra (meta)genomiska dataanalysmetoder tillgängliga och tillgängliga för alla genom undervisning och uppsökande verksamhet.