Fredrik Almqvist

Min forskning fokuserar på metodutveckling inom organisk syntes och design och syntes av molekyler som interagerar med makromolekyler, särskilt hämning av proteinproteininteraktioner. Exempel på det senare är utveckling av hämmare av bakteriell makromolekylär montering och amyloidformation. Min forskningsgrupp har banat väg för design och syntes av ring-smälta 2-pyridonföreningar som peptidomimetik och tillsammans med Dr. Hultgrens labb vid Washington University i St. Louis visat att dessa mimetiska mönster är idealiska för utveckling av antivirulensföreningar.

Vi har utvecklat små molekyler som kallas "pilicider" som hämmar chaperone-usher pathway (CUP) pili, som är viktiga virulensfaktorer hos uropatogent E. coli (UPEC) och detta har resulterat i en djupare förståelse för reglering av CUP pili biosyntes och UPEC:s förmåga att etablera biofilmsbildning. Tillsammans med Dr. Chapman vid University of Michigan FA har vi vidare studerat en delmängd av piliciderna som kallas "curlicider" som är beroende av substitutionsmönstret på det centrala fragmentet har förmågan att påverka curli-monteringen i E. coli. Dessa föreningar är utmärkta verktyg i strävan efter en större förståelse för mekanismerna bakom amyloidmontering i allmänhet men curlimontering i synnerhet. Både pili och curli är viktiga beståndsdelar i olika bakteriella biofilmer och gruppen har ett allmänt intresse av att utveckla biofilmshämmare.

I detta sammanhang startade jag för några år sedan ett samarbete med Dr. Christina Stallings vid Washington University i St. Louis för att utveckla sin upptäckt av mycobakteriella toleranshämmare (MTI:er) och undersöka och förstå det exakta verkningssättet för MTI:er. Dessa nya föreningar har stor potential att förbättra behandlingssätten för tuberkulos, den dödligaste smittsamma infektionssjukdomen i världen. Det breda utbudet av hämmare som har utvecklats i labbet har lett till flera tvärvetenskapliga samarbeten och bland dessa har jag pågående forskning med UCMR-forskare Dr. Sven Bergström och Åsa Gylfe (Klamydia), Jörgen Johansson och Elisabeth Sauer-Eriksson (Listeria) och Johan Normark (Tuberkulos) i syfte att förbättra effektiviteten och dissekera exakta handlingssätt.