Prefekten är ytterst ansvarig för forskarutbildningen på institutionsnivå. Vid varje institution finns en forskarutbildningsgrupp som bereder dessa frågor. Gruppen består av representanter för både handledare och doktorander. Ordförande i gruppen representerar institutionen i Rådet för utbildning på forskarnivå (RUF).
Ulrika Harju (sammankallande, administratör) Catrine Anyango-Odhiambo (doktorandrepresentant) Isabel Goicolea Marie Lindqvist
Institutionen för folkhälsa och klinisk medicin
Per Wester (ordförande) Alva Hansson (doktorandrepresentant) Elin Lindahl (samordnare) Maria Sandström (administratör) Malin Sjöström Jens Wahlström
Institutionen för klinisk mikrobiologi
Constantin Urban (ordförande) Kristina Thelin (administratör) Johan Normark Anders Sjöstedt Mattias Forsell Anna Överby Wernstedt
Institutionen för klinisk vetenskap
Aleksandra McGrath (ordförande) Ruben Kreku (doktorandrepresentant) Karin Brunnegård Inga Dennhag Isabell Hedberg (doktorandrepresentant) Thorbjörn Holmlund Annika Idahl Jussi Jokinen Fredrik Nylén Torbjörn Lind Anders Behndig Peter Sundström Karin Moström (administratör) Maud Normark (administratör) Olof Sandström David Lindquist Helena Harding
Institutionen för medicinsk biovetenskap
Karin Nylander (ordförande) Olivia Carlund (doktorandrepresentant) Johan Hultdin
Institutionen för medicinsk och translationell biologi
Paul Kingham (ordförande) Linnéa Andersson (administratör) Vanessa Crine (doktorandrepresentant) Mikko Lammi Sara Wilson Simon Tuck (Avdelningen för molekylär medicin) Ulf Ahlgren (Suppleant Avdelningen för molekylär medicin)
Institutionen för molekylärbiologi
Johan Holmberg (sammankallande) Felipe Cava Margalida Esteva Socias (doktorandrepresentant) Jörgen Johansson Jan Larsson Peter Lind Barbara Sixt Viktor Skog (administratör)
Åsa Audulv (ordförande) Ulf Isaksson Susanne Ragnarsson Karin Bölenius Annika Backman Maria Lindqvist Birgitta Nilsson (administratör) Anna-Lena Stenlund (doktorandrepresentant) Ingrid Olsson (doktorandrepresentant) Stina Kallerhult-Hermansson (doktorandrepresentant)
Institutionen för samhällsmedicin och rehabilitering
Martin Björklund (ordförande) Johanna Frank (administratör) Anders Eriksson Xiaolei Hu Hugo Lövheim Gustaf Magaard (doktorandrepresentant) Margarita Mondaca Christer Malm