Till sin hjälp har prefekten olika råd och arbetsgrupper som förbereder ärenden.
Forskningsstrategiska rådet
Bereder frågor rörande forskning och leds av biträdande prefekt Magnus Wolf-Watz
Rådet för utbildning på grund- och avancerad nivå
Behandlar frågor rörande utbildning och kurser, liksom ansvar för institutionens rekryteringsarbete. Leds av biträdande prefekt Patrik Andersson.
Forskarutbildningsråd
Utgör ett generellt forum för alla frågor som rör forskarutbildning och är en remissinstans rörande forskarutbildningsfrågor. Leds av ställföreträdande prefekt Anna Linusson Jonsson
Infrastrukturrådet
Bereder frågor rörande infrastrukturen inom institutionen. Leds av biträdande prefekt Madeleine Ramstedt
Administrativ stödfunktion
Till stödfunktionen tillhör ekonomi, HR, studie, IT samt kommunikation. Stödfunktionen leds av administrativ chef Rosita Nilsson.