Institutionen för medicinsk och translationell biologi erbjuder ett postdoktorsstipendium inom projektet ”Regulatory interactions directing early brain patterning and cell type specification”. Stipendiet avser två år med tillträde 2025-08-15 eller enligt överenskommelse.
Forskargruppen ledd av Andreas Hörnblad vid Umeå universitet söker en högmotiverad postdoktor för ett tvåårigt stipendium inom funktionell genomik. Projektet fokuserar på cis-regulatoriska mekanismer och funktion av transkriptionella enhancers under utveckling, patterning och differentiering av hjärnan hos ryggradsdjur.
Laboratoriet har en stark bakgrund inom genreglering och utvecklingsbiologi och är baserat vid Institutionen för medicinsk och translationell biologi vid Umeå universitet. Institutionen bedriver stark forskning inom cancer, genetik, neurovetenskap, metabolism och avbildning. Forskargruppen har tillgång till god infrastruktur och är väl utrustad med nödvändig instrumentation.
Projektbeskrivning
Forskargruppen undersöker de regulatoriska sekvenserna i genomet som styr uttrycket av nyckelgener under embryogenes och vid metabola sjukdomar.
Det specifika projektet integrerar utvecklingsbiologi och funktionell genomik för att studera utvecklingen, mönsterbildningen och evolutionen av midbrain-hinbrain boundary, gränsområdet mellan mitthjärnan och bakhjärnan hos ryggradsdjur som styr utvecklingen av dessa strukturer. Den framgångsrika kandidaten kommer att utföra studier inom forskargruppens program och dra nytta av etablerade knockin-reporterlinjer av zebrafisk för att karaktärisera det regulatoriska landskapet samt interaktionerna mellan transkriptionsfaktorer och de regulatoriska sekvenser som styr differentiering av specifika celltyper under tidig mönsterbildning av hjärnan. Detta innefattar profilering av transkriptionella och regulatoriska landskap med hjälp av olika teknologier för nästa generations sekvensering (RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq), analyser av gen- och proteinuttryck, samt genetisk modifiering av djurmodeller (via CRISPR/Cas9).
Stipendiaten kommer att få möjlighet att:
Utföra forskning inom ramen för gruppens forskningsprogram
Etablera metoder
Analysera och publicera forskningsresultat
Projektledning
Aktivt delta i journal clubs, seminarier, handledning av studenter etc.
Presentera data vid nationella och internationella vetenskapliga möten
Kvalifikationer
För att vara behörig för ett postdoktoralt stipendium ska personen ha avlagt doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då beslut om stipendiatmottagare fattas. För att vara aktuell som postdoktorstipendiat bör i första hand den komma i fråga som avlagt examen högst tre år sedan från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet eller klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga arbetstagarorganisationer eller andra liknande omständigheter.
Doktorsexamen ska vara inom molekylär medicin, utvecklingsbiologi eller liknande
Ytterligare krav är:
Erfarenhet inom next-generation sequencing och funktionell genomik
Erfarenhet av att jobba med vertebrata djurmodeller
Meriterande är:
Bakgrund inom utvecklingsbiologi och genreglering
Erfarenhet med singel-cell genomiktekniker (scRNA-seq och scATAC-seq)
Erfarenhet av kromatinkonformationstekniker
Kompetens inom bioinformatik
Vi söker kandidater som är nyfikna och motiverade postdoktorala forskare med expertis i skärningspunkten mellan funktionell genomik och utvecklingsbiologi.
Den framgångsrika kandidaten måste självständigt kunna planera experiment, utveckla metoder och genomföra dataanalys samt kommunicera resultat. Att kunna sammanfatta resultat muntligt och skriftligt på engelska är ett krav, liksom en god förmåga att samarbeta inom gruppen och med andra forskargrupper. Tjänsten är fullt finansierad i 2 år, men kandidaten kommer även att uppmuntras att söka egna forskningsanslag.
Ansökan
Ansökan ska vara skriven på engelska eller svenska och bifogade dokument ska vara i Word eller pdf-format. Ansökan ska registreras via Umeå universitets e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast 2025-04-30
Ansökan ska innehålla:
Ett personligt brev med forskningsintresse och motivation för ansökan (max 1 sida).
Curriculum vitae (CV) inklusive tidigare positioner, publikationslista och laboratorieteknisk expertis.
Kopior av examensbevis (doktorsexamen och andra diplom) eller dokumentation som klargör när doktorsexamen förväntas erhållas.
Kontaktinformation för tre referenser ska inkluderas i din ansökan, varav minst en ska vara tidigare laboratoriehandledare.
Ansökan måste skickas in via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara oss tillhanda senast den 30 april 2025.
Övrigt och kontakt
För närmare upplysningar kontakta Andreas Hörnblad, Department of Medical and Translational Biology, e-mail: andreas.hornblad@umu.se.
