Institutionen för molekylärbiologi erbjuder ett postdoktoralt stipendium i medicinsk vetenskap med inriktning mot molekylär parasitologi. Stipendiet är för heltidsstudier i två år med start mars 2025 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är 31 januari 2025.
Projekt beskrivning
Bushell labbet är en del av Laboratory of Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS), den svenska noden för det nordiska EMBL-partnerskapet för molekylär medicin. Vi är baserade på Institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet.
Vår forskning fokuserar på att upptäcka de molekylära processer som ligger till grund för de interaktionerna mellan parasit och värddjur som driver malariainfektion och sjukdom. Vi är särskilt intresserade av de proteiner som malariaparasiten aktivt exporterar och som möjliggör en dramatisk ombyggnad av infekterade röda blodkropparna.
Vi utnyttjar den unika genetiska medgörligheten hos gnagarmalaria modellparasiten Plasmodium berghei och utvecklar nya genetiska verktyg och fenotypiska analyser för att förstå funktionen av exporterade parasitproteiner på genomskala in vivo. Vi har tidigare identifierat tusentals parasitgener som krävs för normal parasittillväxt i blodomloppet. Den molekylära funktionen hos de flesta av dessa gener är dock fortfarande okänd.
Vi har nyligen utvecklat PbHiT, ett CRISPR/Cas9-baserat system för effektiv och skalbar genetisk modifiering av P. berghei. PbHiT tillåter oss att konstruera konditionella alleler för att slå ut essentiella gener i stor skala, och för första gången möjliggör poolade CRISPR-screens i malariaparasiter. Detta projekt kommer att dra nytta av utvecklingen av PbHiT för att anpassa perturb-seq-metodologi till P. berghei, vilket kopplar CRISPR-screens med single cell RNA-sekvensering för att läsa ut den fenotypiska effekten av att slå ut en viss gen och därmed läsa ut transkriptom från mutantparasiter i en oöverträffad skala.
Syftet med stipendiet är att främja internationalisering samt bidra till forskningsmeritering i nära anslutning efter doktorsexamen/motsvarande.
Kvalifikationer
För att vara behörig som postdoktor krävs avlagd doktorsexamen eller en utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen i molekylärbiologi, mikrobiologi, immunologi eller relaterade ämnesområden. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då beslut om stipendiatmottagare fattas. För att vara aktuell som postdoktorsstipendiat bör främst den komma ifråga som har avlagt examen enligt föregående stycke för högst tre år sedan. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.
Du ska vara mycket motiverad och ha ett självständigt driv samtidigt som en god samarbets- och kommunikationsförmåga krävs för att kunna interagera effektivt i teamet. Mycket goda kunskaper i engelska i tal och skrift krävs också. Stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.
Den framgångsrika kandidaten bör ha erfarenhet av avancerade molekylära kloningsmetoder såsom Gibson-assembly eller CRISPR/Cas9 vektor -design och -konstruktion, eller erfarenhet av next generation sequencing metoder, i synnerhet RNA -bulk eller -encells sekvensering.
Erfarenhet av hantering av försöksdjur samt av odling och transfektion av eukaryota parasiter är önskvärt. Kunskaper i bioinformatik och programmering är inget krav och utbildning finns, men det är meriterande.
Ansökan
Du ansöker via vårt elektroniska rekryteringssystem Varbi. Sista ansökningsdag är 31 Januari 2025. Ansökan ska skrivas på engelska (helst) eller svenska och ska innehålla:
Ett personligt brev som som tydligt beskriver din forskningserfarenhet, motivation och hur din expertis matchar kraven (högst en A4-sida).
Ett curriculum vitae (CV, max 2 sidor) och publikationslista.
Styrkt kopia av doktorsexamensbevis eller dokumentation som klargör när doktorsexamen förväntas.
Namn och kontaktuppgifter med e-postadresser till två akademiska referenser.
