Institutionen ansvarar för utbildning inom ett flertal biomedicinska program, erbjuder examensarbeten och en högklassig utbildning på forskarnivå.
Institutionen för klinisk mikrobiologi har ett betydande utbildningsuppdrag inom läkarprogrammet, tandläkarprogrammet, biomedicinarprogrammet sjuksköterskeprogrammet, programmet för internationell kris- och konflikthantering och biomedicinsk analytikerprogrammet.
Undervisningen fördelas mellan lärarna inom ämnesområdena virologi, klinisk bakteriologi, infektionssjukdomar, immunologi och klinisk immunologi baserat på deras ämneskompetens.