Forskningsinfrastruktur DNA-metylering är den process genom vilken en metylgrupp läggs till DNA-nukleotider, oftast vid 5-kolpositionen av cytosin (5mC). Metyleringsmodifieringar spelar en avgörande roll för att reglera genuttryck genom att påverka tillgängligheten av DNA. Förändringar i DNA-metyleringsmönster kan påverka olika cellulära funktioner och är inblandade i utveckling, åldrande och sjukdom.
Den epigenetiska plattformen Umeå ligger i Translational Research Centre-byggnaden vid Norrlands Universitetssjukhus och har för närvarande instrumentering för att analysera Illumina-arrayer på blod, formalinfixerad paraffininbäddad (FFPE) och färskfryst vävnad. Plattformen vid Umeå Universitet erbjuder operatörsstödda körningar och bioinformatiskt stöd för dataanalys.
Instrument: Illuimna iScan
Instrumentet kan scanna flera arraytyper, inclusive genotypningsarrayer och metyleringsarrayer. Instrumentet samnyttjas mellan Umeå Universitet och Region Västerbotten.
Methyleringsarrayer: Illumina Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip.
Detta är en högupplöst metyleringsarray som analyserar över 935 000 CpG positioner i genomet.
